Поскольку тысячелистник относится к семейству сложноцветных, то его мелкие цветки собраны в соцветия корзинки, которые в свою очередь образуют сложные щитковидные соцветия на вершине стебля и его разветвлениях.
В каждой корзинке краевые цветки белые (розовые), язычковые, пестичные; а срединные - трубчатые, двуполые, желтые.